آیت‌الله‌العظمی صافی‌گلپایگانی سه ماه قبل از فوت، در دیدار با محمدباقر قالیباف به مشکلات کشور اشاره کرده و گفته بود: «گرانی برای مردم طاقت‌فرسا شده و اینکه با بسیاری از کشورها قهر باشیم، به ضرر مردم است».
حجت‌الاسلام محسن اکبری‌شاهرودی در گفت‌وگو با «عصر ایران» درباره این دیدار که اواخر مهرماه برگزار شد، گفته: «در آن دیداری که قرار بود جناب آقای قالیباف تشریف بیاورند، ایشان به دلایل کسالت و بنا بر دلایلی نمی‌خواستند قبول کنند. به هر حال با اصرار پذیرفتند، اما گفتند اگر من دیدار کنم، حرفم را می‌زنم و باید بگویید که ما در دفاع از نظام و مردم حرف می‌زنیم و ساکت نیستیم. این‌گونه نیست که مردم گمان کنند وقتی مسئولان می‌آیند ما فقط مدح و تمجید کنیم، بلکه تمام هم و غم ما مردم شریف هستند». سخنان این مرجع تقلید با رئیس مجلس باعث شد تا برخی از رسانه‌ها مانند «رجا‌نیوز» و برخی اصولگرایان تندرو به ایشان حمله کنند.
حجت‌الاسلام اکبری‌شاهرودی افزود: «وقتی به ایشان توهین شد، در دفاع از ایشان اصلاح‌طلبان، اصولگرایان و همه جناح‌ها و احزاب وارد شدند. مقاله سعید حجاریان را بخوانید، در این مقاله از آقای صافی بسیار تعریف کرده است با وجودی که ایشان یک اصلاح‌طلب است. اصولگراها و جامعه مدرسین از ایشان دفاع کردند. بالاخره همه وارد شدند چون در ایشان، هوای نفس نمی‌دیدند و کارهایشان را الهی می‌دانستند».
او همچنین نظر مرحوم آیت‌الله صافی‌گلپایگانی درباره «برجام» را این‌گونه عنوان کرد: «از نظر ایشان ارتباط با کشورهای غیر‌اسلامی با ملاک حفظ عزت و هویت اسلامی اشکالی نداشت، همان‌طور که مرحوم امام و رهبری معظم فرمودند و الان هم تصمیم بر همین است. بعضی‌ها که از مواضع ایشان بی‌اطلاع هستند، شروع به اهانت کردند؛ غافل از اینکه مواضع ایشان مورد تأیید امام و مقام معظم رهبری بود. آثار آیت‌الله صافی پر از مخالفت با استکبار و مخالفت با دشمنان اسلام است. کسی نمی‌تواند ایشان را به دوستی و رفاقت با دشمنان اسلام متهم کند».
یکی از مسئولان دفتر مرحوم آیت‌الله صافی گلپایگانی درباره اصرار بر دیدار قالیباف با این مرجع تقلید گفت: آیت الله نمی‌خواستند قبول کنند اما بعد اصرار به ایشان، گفتند اگر دیدار کنم ،حرفم را می‌زنم.
به گزارش تازه نیوز، روزنامه شرق نوشت: مسئول بخش استفتائات و اجازات دفتر مرحوم آیت‌الله‌العظمی صافی‌گلپایگانی، روایتی تازه از دیدار این مرجع تقلید با رئیس مجلس را تعریف کرده است.